I ‘coloni’ dell'isola di San Pietro, giunti sul luogo dove fondarono Carloforte, vi trovarono già l’antico impianto, forse addirittura risalente a cinque secoli prima. La sua costruzione, inoltre, è legata a drammatiche vicende storiche e a leggende mistiche. La chiesa dei Novelli Innocenti sorge su un’altura alla periferia ovest de u Pàize, ‘il paese’ in ligure tabarchino. Si tratta di una ricostruzione avvenuta sulle rovine di un precedente luogo di culto, la cui origine è raccontata attraverso due versioni, una storica, l’altra leggendaria. Secondo la prima ipotesi, il santuario originale risaliva al Medioevo, fatto erigere da papa Gregorio IX a seguito del naufragio sull’isola di due navi. Assieme ad altre cinque, le imbarcazioni dovevano portare numerosi bambini in Terrasanta. La chiesa fu da subito intitolata alle giovani vittime di quella tragedia, e si dice che ne ospitasse le sepolture.